Région hydrographique du fleuve Saint-Laurent (00)
Elle comprend le fleuve Saint-Laurent de la frontière ontarienne à la pointe ouest de l'île d'Anticosti.
Région hydrographique de la baie des Chaleurs et de Percé (01)
Elle comprend le versant du golfe du Saint-Laurent au sud du rocher Percé, celui de la baie des Chaleurs et de la rivière Saint-Jean (Nouveau Brunswick).
Région hydrographique du Saint-Laurent sud-est (02)
Elle comprend le versant du golfe du Saint-Laurent au nord du rocher Percé et celui du sud du fleuve Saint-Laurent jusqu’à la rivière Godefroy inclusivement.
Région hydrographique du Saint-Laurent sud-ouest (03)
Elle comprend le versant sud du fleuve Saint-Laurent à l’ouest de la rivière Godefroy.
Région hydrographique de l’Outaouais et de Montréal (04)
Elle comprend le versant de la rivière des Outaouais, des Mille–Îles et des Prairies et celui du lac des Deux-Montagnes; le versant nord du lac Saint-François, du canal de Beauharnois et les îles de Montréal, Jésus et Perrot.
Région hydrographique du Saint-Laurent nord-ouest (05)
Elle comprend le versant nord du Saint-Laurent et, de la rivière L’Assomption jusqu'à la rivière Saguenay.
Région hydrographique du Saguenay et du lac Saint-Jean (06)
Elle comprend tout le bassin de drainage du lac Saint-Jean et de la rivière Saguenay.
Région hydrographique du Saint-Laurent nord-est (07)
Elle comprend le versant nord du fleuve Saint-Laurent à l’est de la rivière Saguenay et le versant nord du golfe du Saint-Laurent.
Région hydrographique des baies de Hannah et de Rupert (08)
Elle comprend les versants des baies de Hannah et de Rupert.
Région hydrographique des baies James et d’Hudson (09)
Elle comprend les versants des baies James et d’Hudson.
Région hydrographique de la baie d’Ungava (10)
Elle comprend les versants du détroit d’Hudson et de la baie d’Ungava.
Région hydrographique de la mer du Labrador (11)
Elle comprend le versant de la mer du Labrador.
Région hydrographique des îles du fleuve Saint-Laurent (12)
Elle comprend les îles du fleuve Saint-Laurent en excluant les îles de Montréal, Jésus et Perrot.
Région hydrographique des îles du golfe du Saint-Laurent (13)
Elle comprend les îles du golfe du Saint-Laurent, Anticosti et de la Madeleine.